Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SGF29Q96ES7 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SGF29Q96ES7 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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