Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
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GTF3C6Q969F1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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GTF3C6Q969F1 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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GTF3C6Q969F1 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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GTF3C6Q969F1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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GTF3C6Q969F1 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms