Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms