Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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C17orf47Q8NEP4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf47Q8NEP4 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf47Q8NEP4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf47Q8NEP4 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf47Q8NEP4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C17orf47Q8NEP4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf47Q8NEP4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C17orf47Q8NEP4 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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C17orf47Q8NEP4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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C17orf47Q8NEP4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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C17orf47Q8NEP4 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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