Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4BQ8N7F7 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms