Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms