Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms