Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms