Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms