Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms