Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FHOD3Q2V2M9 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms