Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.8 ms