Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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