Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms