Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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