Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYTH1Q15438 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYTH1Q15438 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYTH1Q15438 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYTH1Q15438 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYTH1Q15438 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYTH1Q15438 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYTH1Q15438 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYTH1Q15438 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYTH1Q15438 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYTH1Q15438 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYTH1Q15438 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYTH1Q15438 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYTH1Q15438 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYTH1Q15438 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYTH1Q15438 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CYTH1Q15438 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CYTH1Q15438 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms