Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms