Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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