Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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