Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms