Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
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