Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms