Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PMS2P3Q13401 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PMS2P3Q13401 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PMS2P3Q13401 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PMS2P3Q13401 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PMS2P3Q13401 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PMS2P3Q13401 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PMS2P3Q13401 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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