Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD1Q13393 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD1Q13393 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms