Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.9 ms