Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SCGB2A2Q13296 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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SCGB2A2Q13296 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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SCGB2A2Q13296 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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SCGB2A2Q13296 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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SCGB2A2Q13296 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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