Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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