Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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FOXF2Q12947 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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