Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms