Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms