Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GBE1Q04446 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GBE1Q04446 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GBE1Q04446 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GBE1Q04446 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GBE1Q04446 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GBE1Q04446 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms