Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms