Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD83Q01151 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD83Q01151 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD83Q01151 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD83Q01151 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD83Q01151 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD83Q01151 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD83Q01151 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD83Q01151 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD83Q01151 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD83Q01151 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD83Q01151 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD83Q01151 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD83Q01151 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CD83Q01151 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CD83Q01151 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD83Q01151 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD83Q01151 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD83Q01151 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD83Q01151 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD83Q01151 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD83Q01151 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD83Q01151 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD83Q01151 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD83Q01151 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD83Q01151 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD83Q01151 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD83Q01151 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD83Q01151 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD83Q01151 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD83Q01151 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD83Q01151 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD83Q01151 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CD83Q01151 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD83Q01151 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms