Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms