Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX1P78337 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms