Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms