Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.8 ms