Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms