Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms