Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms