Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.2 ms