Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GATMP50440 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATMP50440 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATMP50440 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATMP50440 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATMP50440 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATMP50440 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATMP50440 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATMP50440 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATMP50440 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GATMP50440 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATMP50440 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATMP50440 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATMP50440 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATMP50440 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATMP50440 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATMP50440 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms