Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 NME6-211ENST00000447314 621 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms