Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GGCXP38435 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GGCXP38435 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GGCXP38435 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GGCXP38435 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GGCXP38435 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GGCXP38435 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GGCXP38435 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GGCXP38435 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms