Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT9P35527 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT9P35527 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT9P35527 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT9P35527 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT9P35527 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT9P35527 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT9P35527 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT9P35527 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT9P35527 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT9P35527 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT9P35527 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT9P35527 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT9P35527 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms