Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms