Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP2P32456 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP2P32456 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP2P32456 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP2P32456 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP2P32456 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP2P32456 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP2P32456 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP2P32456 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP2P32456 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP2P32456 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms