Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC13P31276 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC13P31276 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC13P31276 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC13P31276 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC13P31276 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms