Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms