Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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PTPRMP28827 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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